这是一场被加尔德罗贝封印的战争。讲述风华王家之秘，和爱莉卡的母亲＝雷娜·塞亚斯的故事。

　　憧憬着乙HiME的少女＝西弗尔。某一天，魔手袭击了在无依无靠的同时仍坚强生存着的她。谜之组织「希巴鲁兹」们拐走了西弗尔。在危急时刻，将她救出的是黑衣绅士＝布鲁斯，他的女仆(?)＝蕾娜，紫苑修女和她的乙HiME＝Meister拉凯尔，以及五柱·一之柱=艾利奥特。

　　少女西弗尔之谜。

　　拥有乙HiME力量却将其拒绝的蕾娜。

　　加尔德罗贝之谜。

　　五柱的背叛。

　　现在，正是先代乙HiME觉醒之时。

　　标题中的“S.ifr”包含了两层意思：其一，它在阿拉伯语中是0的意思；其二，它也提示了作品中的主要角色西弗尔・布兰（Sifr Flan）。